阳城县科惠微生物研究所成立于2009年，是专业从事食用菌菌种研究、推广、开发的科研机构，同时也是山西省农业科学院苔蘑产业化推广基地、山西省农科院食用菌研究所科技示范推广基地、九三学社山西省委员会食用菌科技合作示范基地、山西省食用菌协会常务理事单位。目前研究所拥有先进的菌种开发培育设备和真菌研究仪器、原种培育室、栽培种培育室、实验室、冷库储藏室约1000平米，设施齐备。拥有中高级技术员6名，技术顾问1人，年菌种培育能力达100万斤，可满足1000万袋栽培袋菌种需求(干料3斤/袋)，还具备为种植户提供食用菌栽培各项服务和回收食用菌菌品的能力。
    在实践中，研究所以“让科技惠及大众”为宗旨，坚持“自主创新、服务菇农、共同发展、实现双赢”的原则，为菇农提供春栽香菇、高温反季节香菇，秋栽香菇、白灵菇、苔蘑、金针菇、猴头菇、杏鲍菇、平菇等七大类优质菌种，提供产前、产中、产后全程技术跟踪服务，提供各种菌品的销售服务，
大力推广国内先进的食用菌栽培技术及病虫害防治技术。
    去年以来，研究所培育香菇、杏鲍菇、苔蘑、白灵菇、猴头菇、平菇等各类菌种90余万斤，除供应本县各乡镇及食用菌龙头企业使用外，还销往河南、晋城、长治、沁水等地。研究所拥有标准钢架温室栽培大棚20余栋，白灵菇栽培50万袋；猴头菇栽培30万袋；平菇栽培130万袋。直接服务的种植香菇栽培户涉及九个乡镇共计670万袋，年产量达1760万斤鲜菇，帮助菇农增收5280多万元，同时为农村剩余劳动力就业增收提供了新途径。
    为提高食用菌种植户的栽培技术，研究所先后邀请食用菌专家为全县食用菌种植户培训5次，在生产季节直接进棚入户实地指导。6名技术人员全年不间断巡回指导，生产季节入驻食用菌栽培户，为他们提供技术指导，解决技术难题。
    通过研究试验，研究所掌握了温室大棚春栽桑枝香菇标准化生产技术，反季节高温桑枝香菇栽培技术及温室大棚桑枝白灵菇标准化生产技术并应用推广。在寺头乡和驾岭乡成功推广了简易大棚春栽桑枝香菇标准化生产技术，在卧庄村和西关村推广了温室大棚秋栽桑枝香菇标准化生产种植技术，在横河、芹池、驾岭三个乡镇开展段木黑木耳试种并获得成功，取得了明显的经济效益，受到种植户欢迎。研究所还投资十多万元建设了冷藏库，在高温季节收贮鲜菇，帮助种植户解决了夏季鲜菇无法保鲜的难题。研究所还聘请技术人员对桑枝灵芝进行了试验栽培并获得成功，此项栽培方法经申请后取得了国家知识产权局发明专利授权。完成了阳城县六个香菇品种适应性筛选工作，已报省农科院和省食用菌协会。完成了省农科院确定的苔蘑在阳城县的适应性生产，取得了试验数据和生产经验。研究所将进一步加强研发力量，加强与各栽培大户和食用菌专业合作社的沟通与协作，尽最大努力为种植户提供优质的产前、产中和产后服务。
    2010年，阳城县科惠微生物研究所成为山西省食用菌行业十大优秀企业之一。2011年被晋城市科技局、阳城县委县政府和阳城县科技局授予先进集体荣誉称号。山西农业大学“农科教、产学研”食用菌示范基地和山西省现代农业食用菌产业技术体系综合实验站在阳城县科惠微生物研究所县落地，为阳城县食用菌产业发展奠定了坚实的基础。