不断强化顶层设计与体系能力建设。农业部牵头编制印发了《全国农业可持续发展规划（2015-2030年）》等文件，明确了农业资源环境保护与治理的总体思路，提出了“一控两减三基本”的工作目标。同时，形成了四级农业环境保护管理体系，初步构建了全国农业面源污染监测网络，建成了国家、省、市、县的四级耕地质量监测网络等，不断提升监测能力。如湖南省在治理重金属污染耕地过程中，采取逐步加密、分级、分区域组织开展稻米重金属和产区土壤重金属污染“一对一”普查监测的方法，累计调查取样10万多个，摸清了长株潭地区土壤重金属污染和稻米重金属超标分布区域、面积和程度。根据重金属污染程度的不同，实行分区治理。

    农业面源污染防控工作迈上新台阶。一是大力推进化肥农药科学施用。全面普及测土配方施肥技术，深入实施绿色防控，开展农作物病虫专业化统防统治与绿色防控融合推进试点建设，特别是在2015年初,还启动实施了化肥农药使用量零增长行动。 二是积极推进畜禽养殖污染防治。加快推进畜禽养殖标准化建设，启动实施畜禽养殖废弃物综合利用试点项目，因地制宜发展农村沼气工程。浙江把畜禽养殖污染治理作为农业面源污染治理的重中之重，指导监督全省1万多家年存栏50头以上规模养殖场逐场逐户制定治理方案，采取生态消纳、工业化治理和截污纳管等方式进行治理，到今年6月底，完成率87.4%。三是深入开展秸秆综合利用。会同国家发展改革委启动实施秸秆综合利用项目，启动京津冀地区镇域级秸秆全量化利用示范区建设，加快推进秸秆利用的规模化、产业化发展。 四是着力解决农田残膜污染。配合国家标准委开展地膜标准修订工作，连续4年实施废旧地膜回收利用为主的农业清洁生产示范项目，在西北、华北地区安排地膜覆盖等旱作农业技术补助资金，启动实施可降解地膜对比试验。

    农产品产地环境治理工作取得新突破。一是加强产地环境安全管理。制定了《农产品产地安全管理办法》等相关产地环境国家和行业标准120余项，为农产品产地环境保护和安全监管提供有力保障。二 是实施产地土壤重金属污染综合防治。2012年启动实施覆盖全国16.23亿亩耕地、130余万个样点的农产品产地土壤重金属污染普查，并布局了15.2万个国控长期定位监测点，建立了监测预警长效机制；建设重金属污染治理修复示范区9处，在重度污染区实施禁止生产区划分试点。 三是加强农产品产地土壤污染治理修复。重点针对“镉大米”问题，印发了《稻田重金属镉污染防控技术指导意见》和《稻米镉污染超标产区种植结构调整指导意见》。

    农业资源保护工作进一步加强。在耕地资源保护上，实行最严格的耕地保护制度和最严格的节约用地制度，加强高标准农田建设，实施土壤有机质提升行动，不断强化耕地质量建设与管理，实施盐碱化、涝渍化等中低产田改造。 在农业水资源利用上，实施旱作节水农业示范基地和农田节水技术示范项目，推进节水工程改造，加快农业高效节水体系建设。 在草原生态保护上，推行基本草原保护、禁牧休牧和草畜平衡制度，有计划地推进退耕还林还草，实施草原生态保护补助奖励政策，草原生态恢复加快。

    在渔业资源养护上，加强水生生物自然保护区和水产种质资源保护区建设，大力实施增殖放流，严格执行休渔禁渔制度。 在农业物种资源保护上，建立种质资源库、保护区和保护地相结合的种质资源保护体系。开展农业野生植物资源调查和抢救性收集，保存农业野生植物资源3万多份，建成农业野生植物原生境保护区（点）168处。出台了《国家重点管理外来入侵名录（第一批）》，推进外来入侵物种综合防治和资源化利用示范建设，切实做好外来入侵物种灭除和应急防控。