英国脱欧将对欧盟农业食品部门和未来欧盟农业和相关政策造成潜在影响。由于英国是欧盟预算的净贡献者，以及欧盟农业食品的净进口国，并在研究条款上有举足轻重的作用，它的退出将对欧盟农业和食品部门产生广泛的负面影响。在部长理事会讨论未来的农业、贸易和监管政策时英国缺席，这会产生积极或消极影响，取决于在这些领域的政策偏好。对于那些主张以市场为导向且强烈支持科学的农业政策和监管制度，它的退出将是一个损失。
　　在欧洲一体化更广泛的计划中，这些对欧盟农业食品部门的影响可能会被认为是相对次要的。英国的退出将会使得欧盟发现自己在应对其南部和东部边界的巨大迁移压力争议时的困难，包括财政政策，货币联盟和团结。英国的退出可能会吸引其他国家的效仿，使得欧盟和它的农业政策将面对一个非常不同的未来。
　　1. 对政策法规的影响
　　农业经营环境不断受到政策法规的影响，这些政策法规旨在保护消费者的健康和安全、动植物健康、向消费者提供更多的信息以及保护环境。英国脱欧会如何影响这些领域的欧盟法规仍需要进行公开的讨论。不同领域的影响也不一样，具体的影响取决于法规的性质。
　　在一些地区，英国一直倡导更高的欧盟标准，如在动物福利方面。许多英国人认为英国对欧盟的食品安全、动物健康、动物福利法律方面都产生了积极地影响。另一方面，英国也一直在推动欧盟将“智能法规”提上日程。“智能法规”的目的在于强调应当对重要的建议进行影响能力评估，从而寻求一个可供选择的法规来评估现行法律（“健康检查”）并对拟议定的法规向有关方面咨询。
　　英国政策的另一个标志性特征是风险管理应该基于强大的科学和证据。由于风险管理决策与法律并不匹配，使得欧盟的风险管理政策倍受质疑。预防原则一直是欧盟的主要考虑因素之一，随着英国脱欧，欧盟在制定风险管理政策时可能会更加注重预防原则。
　　2. 对食物和农业研究的影响
　　英国在欧洲的科研领域有着非常重要的作用，包括粮食和农业领域的研究。英国脱欧后，英国未来还将继续参与欧盟的科研可能会被写入英国退出欧盟的协议中。一些非欧盟国家都希望能够参与欧盟地平线2020项目，并且还希望他们的研究人员能够在与欧盟成员国相同的条件下参与项目。在2014年瑞士关于移民政策投票结束后，欧盟委员会暂停了瑞士加入地平线2020项目谈判，并将瑞士降到第三国的地位，无法获得欧盟进一步的资助。如果英国脱欧后处于跟瑞士同样的地位，将不会继续领导地平线2020项目，即使英国可能继续参与项目，也将会在项目的设计中失去发言权。英国曾在这个竞争激烈的资助项目中获得了巨大成功，英国脱欧将使欧洲整体科学水平包括粮食和农业研究受到影响。
　　3. 对欧盟贸易及贸易政策的影响
　　英国脱欧意味着英国和欧盟27国之间的贸易，将由单一市场规则覆盖的内部贸易转变为对外贸易。英国脱欧后与欧盟27国之间的贸易制度的准确性质尚不清楚。英国既希望能够最大限度地发挥贸易自主权，而这也可能造成额外的贸易成本，英国需在两者之间进行权衡。英国可以与欧盟27国协商新的自由贸易协定，避免农产品贸易关税提高。然而，如果英国退出欧盟，更多的贸易成本将主要产生于行政公文（如产品来源证明）、进出口检疫制度以及通关延迟。英国和欧盟对标签、包装、食品添加剂和食品成分标准的越来越多不同制度将造成更高的交易成本。
　　英国是农业食品的净进口国，其中大部分进口产品来自于欧盟。英国脱欧将提高欧盟27国大多数农业食品的自给率水平。目前，欧盟企业主要向英国市场出口农产品是因为单一市场规则保障了交易成本达到最低，以及英国除欧盟外的第三方国家应用较高的关税税率贸易保护政策。英国脱欧后，欧盟出口商将面临来自英国及其他国家生产商的竞争条件的变化。如果英国政府脱欧后为了解决粮食自给问题，对其农业部门提供更大的支持，欧盟的生产商或将面临来自英国生产商的更加激烈的竞争。然而，如果英国脱欧后的政策进一步降低对英国农业的支持，欧盟的生产者可能开拓出欧盟以外的更多机会。
　　如果英国脱欧后申请更低的针对第三国的进口保护，那么即使欧盟企业继续免税进入英国市场，他们也将在英国市场面临更大的竞争。此外，即使英国继续维持一个类似欧盟的关税结构，也可能会加入自由贸易协定，而自由贸易协定将使得第三国进入英国市场更加便利，同样会加剧欧盟出口商的竞争。受影响最严重的国家（即英国最大的农业食品进口来源）将是荷兰、法国、爱尔兰。
　　在农产品贸易方面，爱尔兰受到的影响将较为严重。特别是出口到英国的牛肉和奶制品，如果英国对这些产品的出口商放开进口制度，如新西兰、澳大利亚、加拿大、美国等，那么爱尔兰将面临更大的竞争。此外，英国与爱尔兰接壤，如果英国脱欧，爱尔兰将不再有机会进入这一单一市场，那么边境贸易成本将增加。
　　英国脱欧也可能会影响欧盟未来与其他贸易伙伴贸易关系的形成。欧盟正在与美国和南方共同市场进行自由贸易协定谈判，目前与新西兰和澳大利亚的谈判已经成功，而与加拿大的协议正在等待批准。在所有这些谈判中农业部门是极其敏感的，欧盟通常会通过使用关税配额来试图限制在农业领域的市场准入。由于英国传统的贸易立场，在农业贸易中，英国的缺席可能意味着欧盟在这些谈判中将采取一个更强硬的立场。