近年来，牡丹江市全面实施了“科技强菌”战略，黑木耳、猴头菇、滑子蘑为代表的三大食用菌种，不仅在产量上实现了新突破，产品质量和效益也有了质的飞跃，黑木耳实现了全年生产。食用菌是牡丹江农业四大主导产业之首。2011年，牡丹江市食用菌栽培规模达28.3亿袋（块），其中，黑木耳总产量占全国的三分之一，年加工量达到11万吨，拉动全市农民人均纯收入2058元，同比分别增长16.5%、34.8%和14.1%。牡丹江市已成为全国食用菌行业增长速度最快、农民增收效果最突出的地区之一，食用菌产业发展领跑全国。
    该市加快建设标准化栽培示范园区，为新品种、新技术推广搭建示范平台。全市乡(镇)级食用菌标准化生产基地达到45个，百万袋以上生产专业村318个，标准化示范园区34个，符合无公害绿色操作规范的食用菌栽培规模达到25亿袋以上，占全市总栽培规模的90%以上。各级供销社和食用菌协会，结合中国食用菌协会“小蘑菇新农村万名菌农培训计划”，共举办各种形式的专家报告会、技术培训班200多场次，累计培训农民2万多人次，增强了广大菌农的科技素质和实际应用能力。
    牡丹江市重点培育发展了一批辐射带动能力强、产业利益连结紧密的食用菌龙头企业。全市17家食用菌龙头企业，年加工量总计达到11万吨，实现产值13亿元。雨润绥阳黑木耳大市场年交易量达到12万吨，交易额突破62亿元，成为全国最大的黑木耳产业集散中心，占据了食用菌产业的制高点。与此同时，牡丹江市通过加大产业指导力度，发展循环经济，食用菌产业链条得以迅速延伸。目前，牡丹江市食用菌产业已细分为近20个环节，全市超过20%的农村人口专业从事食用菌生产、运输、销售工作。全市超过95%的食用菌废弃料得到回收，食用菌产业的经济效益、环境效益和生态效益实现同步提升。
    另外，该市还围绕发展循环经济，推广了废旧菌料、菌袋生产加工木质煤、机制木炭等经济适用技术，全市共建设各类相关企业21户，建立废弃塑料菌袋回收点60处，废弃菌袋回收利用率达到90%以上。
    近年来，牡丹江市还深入开展食用菌文化建设，东宁县、海林市分别被中国食用菌协会评为“全国食用菌文化产业建设先进县”。在全国第十届食用菌新产品新技术展销会上，海林市二道河镇被中国食用菌协会授予“中国黑木耳之乡”荣誉称号。