食用菌产业集聚发展，全市食用菌工厂化生产企业达到32家，建成7600万平方米食用菌生产基地，其中邹城市获批国家农业（食用菌）科技园区，金乡县被评为全国优秀食用菌主产基地县，鱼台县毛木耳荣获“国家地理标志登记保护产品”。现代种业发展提速推进，全市共有规模以上种子企业25家，嘉祥、兖州、鱼台等县市区种业集群发展，共建成5个商业化育种中心、45万亩标准化商业良种繁育基地。