进入５月中旬，受西南暖湿气流和冷空气的共同影响，我国江南、华南大部分地区出现持续性降雨天气。国务院总理温家宝批示指出：在全国抗击非典的特殊时期，各级政府和水利部门要高度重视防汛抗旱工作，明确责任，落实各项措施，确保经济建设正常进行，确保人民生命安全。 国家防总要求各地在抓好非典防治的同时，切实抓好防汛抗洪工作，做到两手抓，两不误。各地要加强领导，落实责任，密切监视水雨情的发展变化，加强汛期值班，加强查险和洪水调度，确保水库、堤防等防洪工程安全。 各地针对目前的汛情都做出了相应部署，湖南省省委书记杨正午、代省长周伯华要求湘江各地主要领导立即深入抗洪一线，全力组织抗洪抢险，确保大堤绝对安全。目前，湖南湘江和资水上游已有３万多名干部、３５万名劳力、１０００多名部队官兵、武警战士投入抢险工作。江西省省长黄智权部署防汛抗洪工作，并派出工作组到灾区，协助有关市县做好抗洪抢险工作。福建省省长卢展工要求各地密切监视汛情，做好保民、安民工作。广东省防汛指挥部发出紧急通知，要求各地立即行动起来，以保护人民生命安全为首要任务，全力做好山洪灾害的防御工作。