针对不少食用菌生产地区受大雨影响严重的情况，福建省农科院专家制定出了相关技术措施，其中竹荪、地栽香菇、茶树菇及工厂化栽培的杏鲍菇、金针菇等食用菌，在洪灾后补救措施各有不同。

    金针菇、杏鲍菇等工厂化栽培菇类：菇房被淹多半伴随着停水、停电，造成菌袋泡水、库温急剧升高，应及时清理被淹的水袋、集中销毁，强行降温温度降至比正常生长温度低1-2℃，并加大通风排湿。同时，做好厂房内外环境卫生，及时清理淤泥，用清水清洗干净后撒些漂白粉或石灰对库房及周围环境进行消毒。

    竹荪：竹荪畦床培养料没有完全被洪水冲毁的应进行重新覆上土，被洪水冲歪斜的菇棚应重新加固。若天气还在下雨，畦床要遮盖薄膜避雨。开沟排水、清淤很重要，记得清理竹荪畦床杂质，摘除烂、死菇，以防病虫害发生，并用5厘米粗的尖棍棒在竹荪畦面两侧每间隔25-50厘米斜插打洞，加强通气和排除培养料积水，促进竹荪菌丝恢复生长。

    香菇：菇棚外沟水要流通，沟水不能往畦床内流，畦沟不能有积水。畦床菌筒要遮盖薄膜避雨，薄膜遮盖要以高拱棚为好，低拱棚容易发生绿霉菌。覆土栽培的香菇畦床菌筒若被洪水泥土覆盖的可用清水冲去，卸掉四周部分围荫物，让其加大通风，天晴后顶棚遮阴物拨开数路，让光照射入棚里，促进菌丝恢复生长。菌筒覆土料被洪水冲走的应等香菇菌丝恢复后，菌皮较硬实时重新覆上土。

    茶树菇：茶树菇等短菌袋的菌筒受洪水淹泡后，应立即把菌筒内的水倒去，加大菇棚通风。同时加强病虫害防治。天晴后亩可用1.8%阿维菌素（乳剂）约1500倍喷雾地面和菇棚四周。