作为一种食用菌生产的新模式，食用菌工厂化生产在我国前景良好并且有巨大的发展空间。首先是市场有空间。目前我国食用菌工厂化生产品种主要是白色金针菇，据保守估计，其生产量占所有食用菌工厂化产品的60%以上，其余品种的栽培数量较少。尽管工厂化栽培的产品成本高，主要消费对象是高端消费群体，但由于生产量少，除个别不适合中国人口味的品种外，大部分品种市场空间还较大；并且随着经济的发展和社会公众生活水平的提高，消费群体将逐渐向中、低端消费者扩展，市场将不断扩大。
    其次是品种有余地，一方面我国目前常规食用菌生产的品种达60余个，应该可以从中筛选出更多适于工厂化生产的品种；另一方面，我国乃至整个亚洲，食用菌工厂化生产的品种还局限于木腐菌，草腐菌的工厂化生产近乎空白，草腐型食用菌的工厂化生产可值得探索、开发；此外，目前生产的品种主要是中、低温型食用菌。从理论上分析，工厂化生产中，对环境升温的成本应该低于降温的成本。因此，中、高温型食用菌工厂化生产的可能性是存在的。
    上海地区的工厂化食用菌代表品牌之一——“雪榕品牌”被认定为上海市著名商标。作为品牌拥有者，上海雪榕生物科技股份有限公司目前金针菇日产120吨，产能国内领先。而其在蟹味菇和白玉菇的工厂化技术上实现了一系列重大突破，填补多项技术空白，创下多项第一，目前日产能已达20吨，居国内同行业第一。据介绍，雪榕生物计划在2012年内完成扩建日产10吨的蟹味菇和白玉菇项目，投产后蟹味菇和白玉菇日产将达30吨，产能将稳居同行业第一。公司做大产量的同时将继续加大对技术研发投入，力争确立在国内甚至国际市场上的技术领先优势，推动整个行业的向前发展。
    分析人士指出，未来，食用菌产业必将打破传统栽培模式，形成以增强科技创新能力和标准化生产、行业龙头企业引领的产业化发展格局。预计到2025年，全国食用菌工厂化总产值有望超过1000亿元人民币。