云南食用菌资源丰富，我国记载有930余种，在云南分布的就有670余种（占全国的74%以上），市场上常见的贸易类群有200种，绝大多数是美味的菌根型食用菌。公认的著名野生食用菌，云南都有分布，如松茸、块菌、羊肚菌、牛肝菌、鸡枞菌、鸡油菌、松乳菇等。

　　“云菌”不仅仅是餐桌上的美味，更是推动当地经济的一大原动力。但乱采乱挖、过度采集现象十分普遍，生态环境出现退化，资源储量和商业产量均呈下降趋势，部分品种临近濒危。不得不由国家濒危部门出面采取限制出口量、颁发许可证等措施来保护。

　　传统研究方法仅能解决个别科学问题，很难对云南食用菌产业有显著影响和提升。只有利用最新的基因组测序技术，对云南食用菌进行基因组解析，从源头出发，以基因组为核心技术，进行基因组相关的一系列研究，最终获得食用菌领域的“话语权”。为此，云南农业大学和云南省高原特色农业产业研究院，联合四川省农科院、中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所，于2015年启动了“云菌基因组研究计划”，计划对100种野生菌进行基因组测序，并建立数据库。

　　目前，项目已进入收尾攻坚阶段，研究人员已经组装好94种野生菌的基因组，研究人员表示，野生菌基因组共享数据库建成后，不仅有利于通过深入分析基因组信息差异，获取有助于促进重要食用野生菌人工栽培和促繁技术的线索，为食用菌产业跨越式发展提供科技支撑；同时，依托基因组信息，解析食用菌营养成分的合成通路，为食用菌健康食品开发提供最佳的食用菌原料。