线粒体参与能量代谢、离子稳态、细胞衰老和凋亡等事件。真菌线粒体基因组通常仅14个保守基因，基因组大小在11 kb至235.8kb 。该研究显示，梯陵羊肚菌线粒体基因组总长度272.2kp，这是迄今为止报道的最大的真菌线粒体基因组。除包含14个保守的线粒体编码蛋白、2个核糖体大小亚基基因rRNA和32个tRNA外，还包含151个非保守线粒体ORF (ncORF)。保守蛋白、核糖体rRNA和tRNA总序列长度仅占基因组8.52%；ncORF总长度达89kb，占总长度的34%。令人意外的是，这些ncORF中108个基因在梯棱羊肚菌营养生长阶段处于活跃表达状态，暗示在梯棱羊肚菌线粒体基因组中可能具有某些特殊功能。

 

     梯陵羊肚菌超大的线粒体基因组中隐匿着大量散在重复序列，在10-5的比对阈值下总计有2216个重复单元，重复序列的总长度占基因组大小的18.7%，部分较大的序列单元具有高拷贝的重复次数。这种高度重复的特征也导致线粒体组装难度较大，课题组采用了一种迂回策略完成了de novo的组装。